Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm4Q6IRU2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tpm4Q6IRU2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tpm4Q6IRU2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tpm4Q6IRU2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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