Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms