Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms