Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms