Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctnna3Q65CL1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctnna3Q65CL1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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