Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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