Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms