Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkciQ62074 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms