Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctr9Q62018 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms