Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms