Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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BcanQ61361 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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BcanQ61361 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BcanQ61361 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms