Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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