Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms