Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik1Q60934 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Grik1Q60934 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Grik1Q60934 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Grik1Q60934 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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