Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms