Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Utp20Q5XG71 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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