Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fam71bQ5STT6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam71bQ5STT6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms