Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms