Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx21Q3UR97 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx21Q3UR97 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx21Q3UR97 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms