Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms