Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3UPC7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms