Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf224Q3UIW8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms