Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trmt1Q3TX08 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt1Q3TX08 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms