Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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RubcnlQ3TD16 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RubcnlQ3TD16 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms