Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rpusd3Q14AI6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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