Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc1Q0VDN7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms