Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms