Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn1Q08091 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms