Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms