Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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