Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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