Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gjb4Q02738 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms