Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms