Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms