Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms