Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbp4Q00724 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms