Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms