Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms