Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms