Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx3P70354 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms