Protein–RNA interactions for Protein: P59268

Zdhhc9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc9P59268 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc9P59268 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc9P59268 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms