Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp25P57080 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms