Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PctpP53808 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PctpP53808 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms