Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Dbx1P52950 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dbx1P52950 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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