Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ClgnP52194 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClgnP52194 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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