Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pa2g4P50580 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pa2g4P50580 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms