Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpreP49446 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtpreP49446 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtpreP49446 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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