Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VdrP48281 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VdrP48281 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VdrP48281 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VdrP48281 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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