Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd4P46935 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms