Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ItgavP43406 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ItgavP43406 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms